再生能源建置是蔡英文當局重大政策，并全力推動海上陸上風力發電機組，但不論是在新北、苗栗、彰化或澎湖新建或擴建風機，幾乎全遭在地居民反對，分指風機噪音干擾生活質量、漁民生計，環團甚至直指海上風機恐加速瀕絕的中華白海豚絕跡。 　　 　　
　　臺“經濟部”推動的離岸風力發電計劃，在彰化芳苑外海打造示范風場，得標的福海風力發電公司計劃建置800至1000座風機，但當地漁民不滿每支風機架設距離僅相隔500米，密集的風機將造成海域被占無法作業，加上福海公司未依承諾施工及發放補償，曾號召80艘漁船掛白布條出海抗爭。
　　
　　彰化環保聯盟總干事施月英更指出，芳苑近海是生態和地質敏感區，也是中華白海豚覓食和繁衍的場所，中華白海豚是瀕臨絕種的第一級保育類野生動物，全臺數量僅剩不到100只，海上風機施工打樁制造海底噪音，加上電纜鋪設恐怕加速白海豚滅亡。 　　 　　
　　上緯公司在苗栗縣竹南外海執行海洋風電計劃，同樣因規劃設置多達30座離岸風機，遭南龍區漁會質疑密集風機嚴重影響漁民生計，多次發動漁民展開陸上、海上抗爭，最后上緯公司以3.05億元（新臺幣，下同）補償款與南龍區漁會達成合作協議，有部分漁民認為補償標準不合理，醞釀后續抗議行動。
　　
　　德商英華威公司在苗栗苑里設置多支陸上風力發電機組，因不少風機距離民宅過近，部分甚至只有60米，持續發出的低頻噪音讓居民受不了“疲勞轟炸”，組成“苑里反瘋車自救會”長期抗爭。自救會發言人、西平里長陳薈茗說，英華威公司當年未先與民眾溝通就將風機架在民宅附近，“誰能受得了轟隆隆地風車轉動聲，整夜鉆進耳朵里？”
　　
　　艾貴風能壹公司則選定新北三芝、淡水區外海規劃設置離岸風力發電機組，今年6月舉辦環境影響公開說明會時，遭當地居民質疑將沖擊漁業資源和天然景觀，現場高呼“滾出去”，迄今仍未達成共識。
　　
　　此外，臺“國發會”規劃自今年起至2020年，投入203億元積極推動澎湖綠能低碳觀光島計劃，其中157億元用于建造風力發電及太陽能光電，歷時2年完成場址環評，因將于湖西鄉、白沙鄉等地再增設風機，長年已飽受低頻噪音困擾的居民發動抗爭，堅決反對臺電于陸上增設風機破壞生活質量與天然景觀。